function M=MarkovJC(a) % MarkovJC.m % % usage: M=MarkovJC(a) % % create a 4x4 Jukes-Cantor matrix with parameter a % % 8/2/03 M=[1-a a/3 a/3 a/3; a/3 1-a a/3 a/3; a/3 a/3 1-a a/3; a/3 a/3 a/3 1-a];